O IESAM tem o compromisso de formar profissionais capazes de integrar conteúdos das ciências naturais, tecnológicas, sociais e humanas para atender às necessidades de gerenciamento sustentável dos recursos naturais, principalmente da Amazônia. Para isso, implementa projetos pedagógicos em consonância com as diretrizes curriculares e padrões de qualidade estabelecidos pelo MEC, tendo estruturas curriculares orientadas para as peculiaridades das vocações regionais e para as exigências técnicas e diversificações do mercado de trabalho.

Esses projetos contemplam ensino e pesquisa, em níveis de graduação e pós-graduação, buscando a difusão e produção do saber, norteados pelos seguintes princípios básicos:

1. Valorizar a competência acadêmica nas áreas ambiental, tecnológica e de engenharias;
2. Interagir com os diversos setores da sociedade para a construção do desenvolvimento regional;
3. Resgatar, preservar e difundir a cultura regional;
4. Difundir o conhecimento regionalmente desenvolvido;
5. Responder com eficiência e eficácia às demandas da sociedade.